Existen dos clases de DNA repetido, el DNA microsatélite y el genoma ampliamente repetido.
El DNA microsatélite está compuesto de secuencias muy cortas (<13 pares de bases) repetidas en tándem.
Las secuencias microsatélite repetidas son comúnmente repetiticiones dinucleótido.
Las secuencias de genoma ampliamente repetido son más largas que las microsatélite (>100 pb) estas secuencias pueden ser encontradas como copias solas dispersadas a través del genoma o como grupos de secuencias relativamente cerca, su característica en común es que estas forman parte de elementos de transposones.
Una secuencia repetida es, como su nombre lo indica, una secuencia que esta repetida varias veces a través del genoma.
En algunos casos las secuencias repetidas están seguidas unas de otras (Tandem), mientras que otras aparecen esparcidas por todo el genoma.
Algunos secuencias reptidas son genes genuinos, pero la mayoría es DNA no codificante.
En la célula eucarionte tenemos cientos o miles de copias que son llamadas secuencias medianamente repetidas, cerca del 25% del DNA humano cae dentro de esta categoría.
Esta incluye múltiples copias de genes altamente usados al igual que rRNA y tramos no funcionales de ADN que están repetidas muchas veces.
Otro 10% del DNA del humano consiste en secuencias que están presentes cientos de miles o incluso millones de veces: las secuencias altamente repetidas.
Estas secuencias son casi todas no funcionales hasta lo que se sabe.