¿Qué son las secuencias repetitivas?

As secuencias repetidas, tamén chamadas elementos repetitivos, repeticións ou ADN repetitivo, son patróns de secuencia que aparecen no ADN (ou tamén no ARN) repetidos en moitas copias ao longo do xenoma. Hai tres tipos principais de secuencias repetidas no ADN: Repeticións terminais. Repeticións en tándem: As copias da secuencia estão adxacentes unhas das outras, agrupadas en tándem de forma directa ou invertida. Podem ser: ADN satélite. Atópase tipicamente nos centrómeros e zonas de heterocromatina. ADN minisatélite. Unidades repetidas de 10 a 60 pares de bases, que se encontran en moitos lugares do xenoma, tamén nos centrómeros. ADN microsatélite. Unidades repetidas de menos de 10 pares de bases; que inclúen os telómeros, que teñen unhas unidades de repetición de 6 a 8 pares de bases. Repeticións intercaladas (ou elementos nucleares intercalados). Dispersos polo cromosoma e non agrupados, pero pode haber centos de miles de copias deles. Elementos transpoñibles (ou transposóns, ou retroelementos). Poden copiarse e inserirse noutro lugar do xenoma. Algúns teñen que transcribirse primeiro a ARN e despois de novo a ADN e xa se poden integrar, e denomínanse retrotransposóns, como os SINE e LINE, pero outros cópianse a ADN por medio dunha transposase e xa se poden integrar. SINEs (Short Interspersed Nuclear Elements, Elementos Nucleares Intercalados Curtos). Son retrotransposóns non autónomos, que non se poden replicar por si mesmos, pero si se está presente unha transcriptase inversa. Nos primates a maioría son as secuencias Alu. LINEs (Long Interspersed Nuclear Elements, Elementos Nucleares Intercalados Longos). Son retrotransposóns sen LTR, que se poden replicar autonomamente e inserirse no xenoma, xa que codifican a súa propia transcriptase inversa e endonuclease. Nos primates a maioría son as secuencias LINE-1. Nos procariotas os CRISPR son conxuntos de repeticións alternativas e espazadores. CRISPR significa Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (Repeticións Palindrómicas Curtas Intercaladas Regularmente Agrupadas) e son loci de ADN que conteñen repeticións curtas de secuencias de bases. Cada unha das repeticións vai seguida de curtos segmentos espazadores, os cales se orixinaron debido a infeccións anteriores por virus bacteriófagos. As secuencias repetidas poden clasificarse nos seguintes tipos: Repetición directa. Repetición directa global. Repetición directa simple local. Repetición directa local. Repetición directa local con espazador. Repetición invertida. Cada repetición vai seguida augas abaixo por outra igual mais invertida (o complemento inverso). Repetición invertida global. Repetición invertida local. Repetición invertida con espazador. Repetición palindrómica. Repeticións espello e evertidas

Las repeticiones en tándem son secuencias de ADN que se producen cuando se repite un patrón de uno o más nucleótidos y las repeticiones son directamente adyacentes entre sí. Varios dominios de proteínas también forman repeticiones en tándem dentro de su estructura primaria de aminoácidos, como las repeticiones que se dan en el genoma del armadillo. Un ejemplo sería: ATTCG ATTCG ATTCG en el cual la secuencia ATTCG se repite tres veces. Cuando se repiten entre 10 y 60 nucleótidos, se llama minisatélite. Los que tienen menos se conocen como microsatélites o repeticiones cortas en tándem. Cuando se repiten exactamente dos nucleótidos, se llama una repetición de dinucleótidos. Cuando se repiten tres nucleótidos, se denomina repetición de trinucleótidos. Las repeticiones en tándem describen un patrón que ayuda a determinar los rasgos heredados de un individuo. Pueden ser muy útiles para determinar la paternidad. Las repeticiones cortas en tándem se utilizan para ciertas pruebas de ADN genealógico. El ADN se examina a partir de microsatélites dentro del ADN cromosómico. La paternidad se puede determinar a través de la similitud en estas regiones. Las repeticiones en tándem polimórficas también están presentes en los microorganismos y se pueden usar para rastrear el origen de un brote. En el campo de la informática, las repeticiones en tándem en cadenas se pueden detectar de manera eficiente utilizando árboles de sufijos o matrices de sufijos.

Una secuencia repetida es, como su nombre lo indica, una secuencia que esta repetida varias veces a través del genoma. En algunos casos las secuencias repetidas están seguidas unas de otras (Tandem), mientras que otras aparecen esparcidas por todo el genoma. Algunos secuencias reptidas son genes genuinos, pero la mayoría es DNA no codificante. En la célula eucarionte tenemos cientos o miles de copias que son llamadas secuencias medianamente repetidas, cerca del 25% del DNA humano cae dentro de esta categoría. Esta incluye múltiples copias de genes altamente usados al igual que rRNA y tramos no funcionales de ADN que están repetidas muchas veces. Otro 10% del DNA del humano consiste en secuencias que están presentes cientos de miles o incluso millones de veces: las secuencias altamente repetidas. Estas secuencias son casi todas no funcionales hasta lo que se sabe. Cabe mencionar que la división entre el DNA moderadamente repetitivo y el altamente repetitivo algunas veces es arbitraria. Casi la mitad del genoma humano está compuesto de algunas secuencias de DNA que están repetidas bastantes veces en el genoma. Existen dos clases de DNA repetido, el DNA microsatélite y el genoma ampliamente repetido.